根據(jù)清科集團旗下私募通統(tǒng)計，截止到2016年6月新三板掛牌企業(yè)數(shù)量達到7685家，本月新增掛牌企業(yè)共249家，環(huán)比降低49.3%，其中新增的做市企業(yè)數(shù)量有37家；在所有掛牌企業(yè)中，有VC/PE支持的共75家，占比30.1%，環(huán)比下降了29.3%。掛牌數(shù)量對比5月接近“腰斬”，存在著公司由于需要補充半年報數(shù)據(jù)而不得不耽擱申報掛牌，而且目前新三板市場中符合掛牌要求的企業(yè)大部分已入場，還可能是由于企業(yè)存在著申報掛牌時直接進入創(chuàng)新層的打算，因而不急于掛牌。

6月24日股轉系統(tǒng)正式發(fā)布了創(chuàng)新層掛牌公司名單的公告，此次分層，共有953企業(yè)入選創(chuàng)新層，其余6732家企業(yè)自動成為基礎層企業(yè)，入選比例約為12.0%。27日起，新三板市場正式迎來了分層時代。

6月新三板市場總成交金額為122.29億元人民幣，其中做市轉讓成交額為65.37億元人民幣，較4月的79.29億元人民幣下降了21.3%，協(xié)議轉讓成交額56.92億元人民幣，與5月基本持平。創(chuàng)新層和基礎層的企業(yè)6月成交金額都維持在14億元人民幣左右，創(chuàng)新層和基礎層企業(yè)成交總量分別為2.02億股和5.79億股，日均成交數(shù)量為21.18萬股和8.60萬股?？傮w來說，創(chuàng)新層企業(yè)的交易狀況還是好于基礎層企業(yè)，交易頻率更高，融資能力更強。

6月初，全國股轉系統(tǒng)給各主辦券商下發(fā)了《關于加強掛牌公司重大事件信息披露的通知》，規(guī)定掛牌公司涉及重大事件的應及時披露相關信息，用以減少大股東頻繁占款、實際控制人跑路的違規(guī)現(xiàn)象。志能祥贏掛牌之時存在著信披違規(guī)，使得其與創(chuàng)新層企業(yè)失之交臂，也顯示出了監(jiān)管層對于信息披露的重視程度。6月末，股轉系統(tǒng)發(fā)布了《關于終止朗頓教育和中成新星股票掛牌的公告》，除了這兩家沒有按時披露年報的企業(yè)被強制摘牌外，另有5家公司提交的主動終止掛牌申請正在核查中。這是股轉系統(tǒng)首次實施的強制摘牌舉措，同時表示，將加快制定出臺掛牌公司終止掛牌的實施細則，建立常態(tài)化退出機制。

6月股轉系統(tǒng)還發(fā)布了《全國中小企業(yè)股份轉讓系統(tǒng)主辦券商內核工作指引(試行)》的公告，進一步明確了主辦券商內核職責及工作要求。此外，證監(jiān)會部署了對于上市企業(yè)欺詐發(fā)行和信息披露違法違規(guī)行動，其中中介機構也將被嚴查。資本市場的從嚴監(jiān)管同樣對掛牌企業(yè)尤其是創(chuàng)新層企業(yè)的主辦券商來說也有所約束。

在市場擴容的背景下，企業(yè)融資總額和融資價格卻呈下滑趨勢。盡管市場對創(chuàng)新層改善市場整理流動性有著不小的期待，新三板分層后預計有大資金熱情釋放的現(xiàn)象并沒有上演。新三板交易額出現(xiàn)了短暫微量上升，但做市指數(shù)卻仍在走下坡。根據(jù)股轉系統(tǒng)披露的數(shù)據(jù)，在分層制度推出后的4個工作日內，日均成交股票數(shù)維持在930-980家之間，成交金額在5億元人民幣左右，考慮到少數(shù)的兩三家公司交易就可能已經(jīng)上億元了，可以推斷大多數(shù)公司已經(jīng)有相當長時間沒有成交金額。A股的持續(xù)低迷一直傳染著新三板，整個市場整體盈利情況不佳，流動性問題仍待改善。

與此同時，新三板定增融資金額連續(xù)跌破億元，6月定增金額僅85.09億元，新股發(fā)行次數(shù)也顯著下降，刷新一年以來的新低，僅195次。新三板年內最大制度利好兌現(xiàn)后，市場預期已經(jīng)發(fā)生轉變，一方面掛牌企業(yè)不急于融資，期待更多的配套措施出臺之時待價而沽，另一方面二級市場的冷凍效應對一級市場融資的傳導影響，引發(fā)投資者的審慎態(tài)度。